import pandas as pd
import numpy as np
import jovian

jovian.commit()

f=open("myOutFile(Uniprot).txt","r")
llista=f.readlines()
f.close()
a_file = open("myOutFile(Uniprot_processed).txt", "w")
for e in llista:
    g=e.replace(';',' ')
    x=g.strip()
    print(x)
    text=x
    print(text, file=a_file)
a_file.close()

f=open("myOutFile(ClinVar).txt","r")
llista=f.readlines()
f.close()
print(llista[0:50000])

df=pd.read_csv('myOutFile(Uniprot_processed).txt', delimiter=' ')
df['Gene_name'] = df['Gene_name'].map(lambda x: x.lstrip('').rstrip('_HUMAN')) # Eliminar '_HUMAN' dels noms
df.head()
# Els codis pfam al tindre'ls separats no m'ho detecta com una unica columna i per això no em deixa fer el df.